O espaço onde funciona a ES/3 de Arouca era uma propriedade privada, pertencente a uma família de Arouquenses. Posteriormente, o edifício da propriedade foi cedido a um colégio privado chamado “Externato da Rainha Santa Mafalda”. Só mais tarde é que foi constituída, oficialmente, pelo Decreto-Lei nº260-B/75 de 26 de Maio de 1975, a Escola Secundária.

Desde essa data, foram feitas alterações nos pavilhões e algumas remodelações, sendo actualmente formada por um edifício designado de “Casarão” (onde funcionam recepção, reprografia/papelaria, Serviços Administrativos, ASE, sala de directores de turma e de atendimento aos encarregados de educação, gabinete da Direcção Executiva, gabinete de psicologia e gabinete de apoio educativo e a sala da Associação de Estudantes), blocos de um a cinco, com salas de aula, salas específicas, laboratórios, biblioteca, bufete, sala de estudo, sala de convívio, sala de professores, anfiteatro, sala do pessoal auxiliar e clubes. A cantina funciona num sexto bloco, sendo munida de palco para actividades culturais e recreativas, alberga ainda o gabinete que serve de sede para a Associação de Estudantes. Possui ainda um pavilhão gimno-desportivo, dois polidesportivos e balneários de apoio. Um outro edifício, denominado de “capela”, serve de sala de apoio ao Curso de Educação e Formação de Empregados de Mesa. 

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